La coproculture est prescrite en cas de diarrhées aiguës suspectées d'être d'origine infectieuse.
Les bactéries pathogènes responsables de gastro-entérites les plus fréquemment isolées en France sont Salmonella et Campylobacter. Même si elle est plus rare en France, Shigella est également systématiquement recherchée dans les coprocultures "standards".
La recherche de ces entéropathogènes dans les selles utilise des milieux sélectifs.
